数量遗传课题组

——中国农业科学院作物科学研究所

2018-12-17
站内搜索       
首页 » 论坛 » 常见问题解答 
帖子内容
1 楼
shuliang318
积分 142
注册 2012-05-10
     
数量性状基因定位研究中若干常见问题的解析
经典数量遗传学建立在多基因假说基础之上,把控制数量性状的基因作为一个整体,重点研究各种遗传效应与遗传方差的分解和估计,不区分个别基因在表型效应上的差异[1~3]。分子标记连锁图谱的大量出现,使得我们可以像研究质量性状基因一样研究数量性状基因,也可以把单个数量性状基因(quantitative trait gene or locus,简称QTL)定位在染色体上,并估计其遗传效应,这一过程称为QTL作图或定位[4]。QTL作图是基因精细定位和克隆的基础,目前已成为数量性状遗传研究的常用手段。QTL定位结果可以帮助育种家获得目标性状的遗传信息,借助与QTL连锁的分子标记在育种群体中跟踪和选择有利等位基因,提高选择的准确性和预见性。但是,在利用QTL作图开展遗传研究的过程中也经常碰到一些问题,这些问题大致可分为有关作图统计方法、有关遗传参数估计、以及有关作图群体及连锁图谱等三大类。笔者试图结合我们近些年的研究工作对具有共性的12个问题做出分析和解答,供广大科研工作者在利用QTL作图开展遗传研究时参考。与作图统计方法有关的四个问题是:LOD的统计学意义是什么?检测QTL的可信度和LOD临界值的关系是什么?如何评价不同的QTL作图方法?提高QTL检测效率的途径有哪些?与遗传参数估计有关的四个问题是:QTL的贡献率是如何计算出来的?如何确定QTL有利等位基因的来源?选择基因型分析的有效性如何?复合性状是否适宜于QTL作图?与作图群体及遗传图谱有关的四个问题是:QTL作图群体中表型数据是否要求服从正态分布?加密标记是否可以显著提高QTL检测功效?缺失分子标记对QTL作图有什么影响?奇异分离标记对QTL作图有什么影响?


点击下载
本帖由 shuliang318 于 2012-05-22 10:38:32 编辑过
2012-05-10 16:53:05 数量遗传课题组管理员
2 楼
shuliang318
积分 142
注册 2012-05-10
     
回复: 数量性状基因定位研究中若干常见问题的解析

2012-05-22 10:39:50 数量遗传课题组管理员
3 楼
hellokitty
积分 12
注册 2013-01-26
     
回复: 数量性状基因定位研究中若干常见问题的解析
您好! 请问这款软件F2群体 最大不能超过256对吧?
2013-01-27 19:18:19
4 楼
shuliang318
积分 142
注册 2012-05-10
     
回复: 数量性状基因定位研究中若干常见问题的解析
可以超过256的
2013-03-21 10:50:43 数量遗传课题组管理员
5 楼
ml
积分 24
注册 2012-06-13
     
回复: 数量性状基因定位研究中若干常见问题的解析
hellokitty 发表于 2013-01-27 19:18:19
您好! 请问这款软件F2群体 最大不能超过256对吧?

使用Excel2007以上的文件就可以放置大于256列的文件。使用文本文件群体可以超过256。
2013-05-10 09:31:49 小编
6 楼
lanyuchunmo
积分 12
注册 2013-07-10
     
求助
安装3.3版本时,总是有错误提示,安装不了,怎么解决啊? 提示信息: “The cabinet file '_A0C6D 1F275F36AF2AB933A3615C87D91' required for this installation is corrupt and cannot be used. This could indicate a network error, an error reading from the CD-ROM, or a problem with this package.”
2013-08-09 16:26:30
7 楼
丁正权
积分 12
注册 2013-08-04
     
回复: 数量性状基因定位研究中若干常见问题的解析
您好!最近安装了3.3版本,
2013-08-22 21:47:40
8 楼
genetics
积分 2
注册 2013-09-17
     
回复: 数量性状基因定位研究中若干常见问题的解析
几年之前做硕士的时候,用mapmaker做过质量性状的遗传距离计算,不知道 QTL IciMapping能否用来做质量性状基因定位?与mapmaker比较,其优缺点是什么?
2013-09-17 08:34:40
9 楼
redchian123
积分 2
注册 2013-10-09
     
回复: 数量性状基因定位研究中若干常见问题的解析
刚刚安装了最新版本,V3.3, 感觉不错
2013-10-09 10:39:23
10 楼
liuxiaogang
积分 2
注册 2013-12-05
     
回复: 数量性状基因定位研究中若干常见问题的解析
能否用icimapping进行RIL群体表型数据分析,得出其遗传参数及遗传模式?
2013-12-22 20:47:48

课题介绍 | 成员介绍 | 联系我们 | 访客留言

© 2012-2018 Quantitative Genetics Group--ICS-CAAS All Rights Reserved.