数量遗传课题组

——中国农业科学院作物科学研究所

2017-9-20
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第十六届 “基因定位与育种设计”研讨会专题
点击数: 230  |  发表时间: 2015-02-04

“基因定位与育种设计”江西培训班在南昌举办

新年伊始,课题组主办的“基因定位与育种设计”江西培训班于2015119-23日在江西省农业科学院成功举办。培训班的每天上午或下午,王建康研究员先做1~2个专题报告,然后由硕士生李珊珊和程序员孟磊带领学员上机实习。报告的内容涵盖了群体遗传学、数量遗传学、重组率估计、连锁图谱构建、常见的QTL定位方法的原理及比较、CSSL等其他群体的QTL定位、QTL定位中常见问题解答、关联分析应注意的问题、无性系F1及双交群体的QTL定位、育种模拟及设计育种等各方面。上机实习内容包括数量遗传学中的常见遗传分析在Excel中的实现、QTL IciMappingGACD两个软件的详细使用。

这期培训班由江西省农科院科技处、江西省农科院水稻研究所/水稻国家工程实验室(南昌)、中国农业科学院作物科学研究所共同举办。来自江西省农科院、南昌大学、江西农业大学、中国农科院棉花所、中科院石家庄农业资源研究中心、东北农业大学、上海农科院、内蒙古农科院、辽宁农科院、山西农科院、河北农科院等单位的80余名代表参加了培训班。江西省农科院副院长余传元、水稻所所长陈大洲、科技处处长廖家槐等相关领导参加了培训班的开闭幕仪式,并就培训班的内容、形式和课题组开发的QTL IciMappingGACD软件给予高度的评价,并期待再次来院举办培训班。学员们认为这次培训班填补了他们数量遗传学的理论和应用空缺,很好地指导了遗传育种工作,对于老师的专题报告和耐心指导深表感谢。

 

 

上课地点:江西省农业科学院创新大楼三楼会议室
住宿地点:江西省南昌县泰豪商务酒店(南昌县公安局对面
1月18日(周日):全天报到,地点在酒店大堂内。到江西省南昌县泰豪商务酒店的乘车路线:从昌北机场,可乘机场大巴——南昌市区老福山站下,换乘公交203路——莲塘站;从南昌火车站,老福山立交乘坐公交203路——莲塘站,也可乘坐出租车至农科院大门下,最晚一班公交车发车时间为晚上10:00点;从南昌西客站(高铁站),乘707路至昌南客运站,然后换乘201路公交至莲塘站。
1月19日(周一):以群体和数量遗传学为主,内容包括群体结构估计,影响群体结构的因素,表型数据方差分析和广义遗传力估计,遗传效应和遗传方差的分解,亲属间的遗传相关和遗传交配设计,狭义遗传力估计,遗传进度估计,相关遗传进度,选择指数,利用Excel进行简单的统计和遗传分析等内容。
1月20日(周二):以连锁分析和遗传图谱构建为主,内容包括遗传学基本规律,两个连锁座位之间的重组率估计,三个座位间的遗传干涉和遗传图距,大量标记的分群和排序,利用QTL IciMapping软件估计重组率、构建连锁图谱、整合多条连锁图谱等内容。
1月21日(周三):以双亲群体加显性QTL作图为主,内容包括QTL作图的基本原理,单标记QTL作图方法,简单区间作图方法,背景遗传变异控制的重要性,完备区间作图方法,QTL作图中的两类错误,不同QTL作图方法的比较,利用QTL IciMapping软件开展QTL作图研究、模拟遗传群体、比较不同方法的QTL检测功效等内容。

1月22日(周四):以双亲群体互作QTL作图和其它群体基因定位方法为主,内容包括上位型互作QTL作图,QTL与环境的互作分析,选择基因型分析,混合分离分析,染色体片段置换系群体的QTL作图,关联分析,QTL作图常见问题解析,利用QTL IciMapping软件开展互作QTL作图研究等内容。
1月23日(周五):上午以无性系物种的遗传分析方法为主,内容包括无性系遗传群体的连锁分析、连锁图谱构建和基因定位方法;下午以育种模拟和育种设计为主,内容包括植物育种方法和程序,植物育种过程的建模和模拟,不同育种方法的模拟比较,已知基因信息的育种设计,利用QuGene和QuLine软件模拟育种过程等内容;最后两个小时为自由讨论和交流,包括对培训班的意见和建议,研究过程中遇到的遗传学和统计学问题等。

 

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